病原：Tuburcinia cepulae (Frost) Liro
病徴：幼苗では第１または第２葉にねじれと共に膨らみを生じ，葉の内側に黒粉状の厚膜胞子を形成する。りん茎では外皮下に黒色の胞子群が縞状に生じる。
伝染：本病菌は被害残渣とともに土壌中で生存し，（１２年間の生存例あり）感染源となる。本病菌は種子の発芽後早い時期に子葉基部などから侵入する。気温１０〜２５度で発生しやすく，２０度で最も発病する。２９度では全く発病しない。種子の深播きは発病を助長する。
防除：苗床にはタマネギ栽培歴のない場所を使用するか，クロルピクリンや臭化メチルで土壌消毒を行う。汚染圃場でも，１５センチ以上の大きさの健全苗を定植した場合には感染しない。